Почему после кондиционера в офисе или автомобиле болит горло?

Потому что любой кондиционер создаёт направленный поток холодного воздуха, возникает разница температур, которую человеческий организм не очень любит.

Судя по всему, вы просто перемерзаете. Происходит это на разности температур во внешней среде и в помещении или авто. 

ЕЕсть несколько причин или вы неправильно выставляете и вас протягивает или после жары вспотевшие сразу под кондиционер.